在2010年，谷歌退出中国市场时，李彦宏的百度不仅未受影响，还巩固了其在国内搜索市场的垄断地位。然而，随着时间的推移，他面临着新的挑战，如文学版权争议和央视对其“凤巢系统”的批评。此外，新兴搜索引擎如搜狐搜狗、腾讯搜搜、360和阿里巴巴的一淘也开始挑战他的地位。移动互联网的发展进一步扩展了搜索行业的空间。
2012年1月1日，百度庆祝成立12周年。在元旦期间，一楼大厅里的液晶屏显示了中国地图，上面标注着各省市，每一次红点闪烁都代表有网民访问了百度网站。过去12年中，百ду专注于搜索，并成为中国互联网行业的一个标杆，但现在正面临着不断创新出现的移动互联网所带来的更新定位。
竞价排名一直是李彦宏最大的疑问之一。这一商业模式为百度带来了巨大利益，也被认为是“原罪”。创业初期，百度主要提供技术服务给门户网站，如硅谷动力。但当这些网站购买技术服务后，没有解决如何盈利的问题，这导致投资回报一直是负数。经过多次碰撞，李彦宏决定推出自己的网站并尝试新的商业模式——竞价排名。
2001年10月22日，即实施竞价排名之前，有超过800个网站加入了这个联盟，使得这一商业模式迅速成功，并帮助公司谋取经济效益。在美国纳斯达克上市后，其股价飞涨，从27美元一路上扬至155美元。但同时，对于竞价排名公平性和合理性的争议始终存在，让百度备受诟病。
2008年的生日前夕，当时央视对 百度进行连续两期报道质疑其商业模式与自然搜索排名的公正性，这些质疑进而被提升为道德问题，使得公司遭遇最严峻危机。而随后的几个月内，其股价急跌，最低到102美元。对于这些质疑，李彦宏表示需要完善运营上的疏漏。
随后，不久之后便推出了一个全新广告系统“凤巢”，以及基于“北斗计划”的网盟推广来替代原有的主题推广。此外，将所有搜索营销业务统一为百度推广。
移动互联网变局
"移动互联业务是一个无处不在的盒子（智能手机），搜索业务一触即发，它将取代手机操作系统，并会颠覆性的改变互联网产业生态。”
12年的轮回再次发生，在移动互联网蓬勃发展下，把所有IT从业者裹挟至这个时代，而是否能够继续领跑中国互联网行业成了问题。
对于在中国互联网行业的地位位置，被私下评价：“新浪是目的站，不是门户，只有搜索引擎才能够将用户导向最佳去处。”但现在社交网络及社会化媒体正在改变信息组织方式。
开放平台让用户更直接选择，可以用非搜索方式解决，比如苹果AppStore，让软件寻找变得媒介、推荐和目录混合体。移动互联正在削弱作为“门户”垄断地位。
为了应对这一趋势，他认为需要加速快跑，因为追赶者的脚步越来越近。他曾说：“超越我们不会是一模一样。”
腾讯发起新规模活动、新浪借势微博兴风做浪；搜狗通过整合效应迅速上位并盈利；淘宝的一淘正在改变选项，这只是变化开始。不过截至目前，由官方发布第三季财报可知分拆一年后的搜狗收入达到1840万美元，与2010同期增长244%，首次突破亿元人民币大关，是继 百度之后第二个盈利的地方单位 公司。这意味着虽然他还有一段距离要走，但追赶者的脚步已经非常接近，而且他们也不想成为第二个相同的事情，他们希望通过其他途径超越他比如360董事长周鸿提到的推荐引擎或浏览器智能等方法。他相信未来属于手机+推荐引擎，而且不会像以前那样输入关键词查询，而是在页面看到推荐内容。这也是为什么他研发半年的探索引擎最近开始内测，就是一种新型个性化推荐技术。