在一个鲜艳的初中校园里，有一对相爱的情侣，男孩叫辉，女孩儿叫小念。女孩儿很漂亮，也很善解人意学习又好，每次考试都会在全校前几名。男孩也很帅气，但老是和同学们一路去打架。女孩儿也常常劝说男孩不要打架，可男孩总是一笑而过，大概说你不懂。
他们的爱情是从小学六年级开始的，也可以说是青梅竹马，天生的一对。在校园里，常常会看到两人牵手，男孩很爱女孩儿，他喜欢叫女孩儿乖乖，因为她很听男孩的话，有时女-girl兒会撒娇的嘟着嘴说；傻猪，我想吃东西，我饿。male主角用手轻轻的捏了female主角的鼻子，然后会搂着female主角的腰说，走！想吃什么？
时间过得快，他们进入了高中三年级生活。在这个阶段，小念因学习成绩优秀，被市里录取到了一所知名高中，而辉却因为分数较低，只能退学。此时，他们之间的心理距离越来越远，一些追求者也纷纷出现。但辉始终无法忘记小念，并决定留在家乡，为她的将来积累财富。
高中的生活结束后，小念被大学录取，而辉则选择留下工作，为未来的日子储蓄。他每天早上送小念去学校，然后自己去上班，在晚上下班后，再接送小念回家。这段期间，他们依然维持着彼此的情感联系，无论是在电话里的温暖交流还是QQ上的隐秘消息。
然而，这段美好的日子并没有持续太久。一场突如其来的病痛夺去了辉生命的小机会。他在医院最后一次见到了小念，当时他已经意识到自己的命运，不再有希望。而现在，他只是静静地看着窗外，那个曾经让他梦寐以求的地方，从此失去了他的脚步。
随着时间流逝，小念完成了大学教育，她成了一个成功的人物，但内心深处依旧怀有一颗空缺。她知道，如果有机会，她一定要回到那个地方，那个充满记忆的地方。那是一个只有两个人才知道的地方，是他们共同编织的一个故事，那是一个关于永恒与真挚、关于无言与默契、关于彼此之间唯一不可替代的情感故事——那就是“三思”，别哭的故事。