在中医理论体系中，“五行六气”是指肝、心、脾、肺、大肠这五个脏腑以及其对应的六种气机。孙思邈作为中国古代著名医学家，其在《千金要方》等作品中，对这一理论进行了深入阐述和实际应用。
首先，孙思邈认为“五行”即人体的主要脏腑器官，它们各自负责不同的生理功能。例如，心主血络，司藏神；肝主筋肉，司藏精；脾主运化饮食为津液，与胃相表里；肺主呼吸与卫外分泌物；大肠主收纳废物并排出体外。在这里，我们可以看到孙思邈通过将人体分为不同的系统来理解其内部运行机制。
其次，“六气”则是指每个脏腑对应的生命活动状态或能量流动。这包括了清热之气（心）、平降之气（肝）、生长之气（脾）、散布之气（lung）、固摄之气（大肠）和通便利湿之道。此处的“六气”，并不仅仅局限于单一的心经而是整个人体各部分都有着自己特定的生命活力，这也是后世所说的“天地万物皆有阴阳”的哲学思想的一种具体表现。
从这些基本概念出发，孙思邈进一步提出了许多关于如何调节这些关系以达到健康的养生原则。他强调需要保持身体内外环境与自然界之间的平衡，即所谓的“天人合一”。他认为人的生活方式应当顺应自然规律，不应该违背自然规律，而应该通过调整自己的生活习惯来适应自然规律，从而达到身心健康。
此外，在治疗疾病时，孙思邈也非常重视这种关系。他认为要诊断疾病必须首先了解患者的情绪状态，因为情绪波动会影响到人的身体状况。如果情绪不稳定，就可能导致内蕴失衡，从而引起各种疾病。在他的治疗方法中，他常常会用药物去调和这个内外之间的关系，以恢复人们正常的人格状态和身体功能。
总结来说，孙思邈对于“五行六气”的理解，是一种集静观察于动治愈于生的全面的看待人类生物学现象的一种方式。他的养生法则，以及他对药食同源、阴阳平衡等理念的大力弘扬，为后世留下了宝贵财富，也使得我们能够更好地理解古代医家的智慧，并借鉴他们丰富多彩的人文科学知识，以期实现更加健康美好的生活态度。